Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6CA6NDK9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6CA6NDK9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA6CA6NDK9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6CA6NDK9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6CA6NDK9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms