Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL33A6NCF5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL33A6NCF5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL33A6NCF5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL33A6NCF5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL33A6NCF5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms