Protein–RNA interactions for Protein: A6H8Y1

BDP1, Transcription factor TFIIIB component B'' homolog, humanhuman

Predictions only

Length 2,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDP1A6H8Y1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BDP1A6H8Y1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
BDP1A6H8Y1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BDP1A6H8Y1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BDP1A6H8Y1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BDP1A6H8Y1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BDP1A6H8Y1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BDP1A6H8Y1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BDP1A6H8Y1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BDP1A6H8Y1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BDP1A6H8Y1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BDP1A6H8Y1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BDP1A6H8Y1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms