Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC35F4A4IF30 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC35F4A4IF30 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC35F4A4IF30 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35F4A4IF30 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.7 ms