Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms