Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf170A2RU37 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf170A2RU37 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf170A2RU37 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms