Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zkscan16A2ALW2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zkscan16A2ALW2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Zkscan16A2ALW2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Zkscan16A2ALW2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zkscan16A2ALW2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zkscan16A2ALW2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zkscan16A2ALW2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zkscan16A2ALW2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zkscan16A2ALW2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zkscan16A2ALW2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zkscan16A2ALW2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zkscan16A2ALW2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zkscan16A2ALW2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Zkscan16A2ALW2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zkscan16A2ALW2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zkscan16A2ALW2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zkscan16A2ALW2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zkscan16A2ALW2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zkscan16A2ALW2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Zkscan16A2ALW2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zkscan16A2ALW2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zkscan16A2ALW2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zkscan16A2ALW2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zkscan16A2ALW2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zkscan16A2ALW2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zkscan16A2ALW2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zkscan16A2ALW2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zkscan16A2ALW2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zkscan16A2ALW2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zkscan16A2ALW2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zkscan16A2ALW2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zkscan16A2ALW2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Zkscan16A2ALW2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zkscan16A2ALW2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Zkscan16A2ALW2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Zkscan16A2ALW2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zkscan16A2ALW2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zkscan16A2ALW2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zkscan16A2ALW2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zkscan16A2ALW2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zkscan16A2ALW2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zkscan16A2ALW2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zkscan16A2ALW2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zkscan16A2ALW2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zkscan16A2ALW2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Zkscan16A2ALW2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zkscan16A2ALW2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zkscan16A2ALW2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zkscan16A2ALW2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zkscan16A2ALW2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zkscan16A2ALW2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zkscan16A2ALW2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zkscan16A2ALW2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zkscan16A2ALW2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zkscan16A2ALW2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zkscan16A2ALW2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zkscan16A2ALW2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Zkscan16A2ALW2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zkscan16A2ALW2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zkscan16A2ALW2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zkscan16A2ALW2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zkscan16A2ALW2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zkscan16A2ALW2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zkscan16A2ALW2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zkscan16A2ALW2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zkscan16A2ALW2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms