Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
FocadA2AKG8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FocadA2AKG8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FocadA2AKG8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FocadA2AKG8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
FocadA2AKG8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
FocadA2AKG8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FocadA2AKG8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FocadA2AKG8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FocadA2AKG8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FocadA2AKG8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FocadA2AKG8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
FocadA2AKG8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FocadA2AKG8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
FocadA2AKG8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FocadA2AKG8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FocadA2AKG8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FocadA2AKG8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FocadA2AKG8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FocadA2AKG8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FocadA2AKG8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FocadA2AKG8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FocadA2AKG8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FocadA2AKG8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FocadA2AKG8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FocadA2AKG8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FocadA2AKG8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FocadA2AKG8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FocadA2AKG8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
FocadA2AKG8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FocadA2AKG8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FocadA2AKG8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FocadA2AKG8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FocadA2AKG8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FocadA2AKG8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FocadA2AKG8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
FocadA2AKG8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FocadA2AKG8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FocadA2AKG8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FocadA2AKG8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FocadA2AKG8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FocadA2AKG8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FocadA2AKG8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FocadA2AKG8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FocadA2AKG8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
FocadA2AKG8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FocadA2AKG8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FocadA2AKG8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FocadA2AKG8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
FocadA2AKG8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FocadA2AKG8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
FocadA2AKG8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FocadA2AKG8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FocadA2AKG8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FocadA2AKG8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FocadA2AKG8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
FocadA2AKG8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms