Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup62clA2AG10 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup62clA2AG10 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup62clA2AG10 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup62clA2AG10 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup62clA2AG10 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup62clA2AG10 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup62clA2AG10 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup62clA2AG10 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup62clA2AG10 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup62clA2AG10 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup62clA2AG10 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nup62clA2AG10 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup62clA2AG10 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup62clA2AG10 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup62clA2AG10 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup62clA2AG10 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup62clA2AG10 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup62clA2AG10 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup62clA2AG10 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup62clA2AG10 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup62clA2AG10 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup62clA2AG10 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup62clA2AG10 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup62clA2AG10 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms