Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930447F04RikA2AFR2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930447F04RikA2AFR2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930447F04RikA2AFR2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930447F04RikA2AFR2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms