Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Itgb4A2A863 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Itgb4A2A863 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Itgb4A2A863 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Itgb4A2A863 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Itgb4A2A863 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Itgb4A2A863 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Itgb4A2A863 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Itgb4A2A863 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Itgb4A2A863 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Itgb4A2A863 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Itgb4A2A863 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Itgb4A2A863 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Itgb4A2A863 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Itgb4A2A863 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Itgb4A2A863 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Itgb4A2A863 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Itgb4A2A863 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Itgb4A2A863 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Itgb4A2A863 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Itgb4A2A863 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Itgb4A2A863 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Itgb4A2A863 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms