Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam171a2A2A699 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam171a2A2A699 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam171a2A2A699 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam171a2A2A699 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam171a2A2A699 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam171a2A2A699 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam171a2A2A699 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam171a2A2A699 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam171a2A2A699 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam171a2A2A699 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam171a2A2A699 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam171a2A2A699 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam171a2A2A699 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam171a2A2A699 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam171a2A2A699 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam171a2A2A699 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam171a2A2A699 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam171a2A2A699 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fam171a2A2A699 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam171a2A2A699 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms