Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMD3A2A2Y4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMD3A2A2Y4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMD3A2A2Y4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMD3A2A2Y4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMD3A2A2Y4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMD3A2A2Y4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMD3A2A2Y4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMD3A2A2Y4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMD3A2A2Y4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMD3A2A2Y4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMD3A2A2Y4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMD3A2A2Y4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMD3A2A2Y4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMD3A2A2Y4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FRMD3A2A2Y4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FRMD3A2A2Y4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMD3A2A2Y4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
FRMD3A2A2Y4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMD3A2A2Y4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMD3A2A2Y4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMD3A2A2Y4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMD3A2A2Y4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD3A2A2Y4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FRMD3A2A2Y4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD3A2A2Y4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD3A2A2Y4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD3A2A2Y4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD3A2A2Y4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD3A2A2Y4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FRMD3A2A2Y4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms