Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM223A0PJW6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM223A0PJW6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM223A0PJW6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM223A0PJW6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM223A0PJW6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM223A0PJW6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM223A0PJW6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM223A0PJW6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM223A0PJW6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM223A0PJW6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms