Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc173A0JLY1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc173A0JLY1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc173A0JLY1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc173A0JLY1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc173A0JLY1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc173A0JLY1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc173A0JLY1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc173A0JLY1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms