Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDL3

2310034G01Rik, RIKEN cDNA 2310034G01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310034G01RikA0A286YDL3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2310034G01RikA0A286YDL3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
2310034G01RikA0A286YDL3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
2310034G01RikA0A286YDL3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
2310034G01RikA0A286YDL3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2310034G01RikA0A286YDL3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2310034G01RikA0A286YDL3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2310034G01RikA0A286YDL3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2310034G01RikA0A286YDL3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2310034G01RikA0A286YDL3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms