Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms