Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A0A0J9YXV3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A0A0J9YXV3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A0A0J9YXV3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0J9YXV3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms