Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms