Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG2

TRBV6-6, T-cell receptor beta variable 6-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV6-6A0A0A6YYG2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV6-6A0A0A6YYG2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV6-6A0A0A6YYG2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV6-6A0A0A6YYG2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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