Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WSZ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WSZ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A087WSZ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A087WSZ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A087WSZ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A087WSZ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A087WSZ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A087WSZ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A087WSZ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A087WSZ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms