Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mdc1Q5PSV9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdc1Q5PSV9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms