Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacs2Q3V3Q7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacs2Q3V3Q7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms