Protein–RNA interactions for Protein: Q12674

DNF3, Probable phospholipid-transporting ATPase DNF3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF3Q12674 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.55□□□□□ -2.66
DNF3Q12674 YGL052WYGL052W 306 nt-1.55□□□□□ -2.66
DNF3Q12674 CBS1YDL069C 690 nt-1.58□□□□□ -2.66
DNF3Q12674 YER053C-AYER053C-A 114 nt-1.58□□□□□ -2.66
DNF3Q12674 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-1.58□□□□□ -2.66
DNF3Q12674 PCC1YKR095W-A 267 nt-1.58□□□□□ -2.66
DNF3Q12674 snR189snR189 189 nt-1.59□□□□□ -2.66
DNF3Q12674 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-1.6□□□□□ -2.67
DNF3Q12674 VPS20YMR077C 666 nt-1.61□□□□□ -2.67
DNF3Q12674 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.67□□□□□ -2.68
DNF3Q12674 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-1.67□□□□□ -2.68
DNF3Q12674 YGR069WYGR069W 336 nt-1.69□□□□□ -2.68
DNF3Q12674 YOR170WYOR170W 306 nt-1.69□□□□□ -2.68
DNF3Q12674 RPS27BYHR021C 249 nt-1.7□□□□□ -2.68
DNF3Q12674 PRM3YPL192C 402 nt-1.7□□□□□ -2.68
DNF3Q12674 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-1.71□□□□□ -2.68
DNF3Q12674 YAR047CYAR047C 321 nt-1.71□□□□□ -2.68
DNF3Q12674 GPI15YNL038W 690 nt-1.71□□□□□ -2.68
DNF3Q12674 TOM22YNL131W 459 nt-1.74□□□□□ -2.69
DNF3Q12674 CSE2YNR010W 450 nt-1.74□□□□□ -2.69
DNF3Q12674 YAF9YNL107W 681 nt-1.74□□□□□ -2.69
DNF3Q12674 snR74snR74 88 nt-1.75□□□□□ -2.69
DNF3Q12674 YER090C-AYER090C-A 90 nt-1.75□□□□□ -2.69
DNF3Q12674 YBR285WYBR285W 435 nt-1.75□□□□□ -2.69
DNF3Q12674 SKI7YOR076C 2244 nt-1.76□□□□□ -2.69
DNF3Q12674 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.77□□□□□ -2.69
DNF3Q12674 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-1.78□□□□□ -2.69
DNF3Q12674 YLR269CYLR269C 351 nt-1.78□□□□□ -2.69
DNF3Q12674 YOR121CYOR121C 306 nt-1.79□□□□□ -2.7
DNF3Q12674 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-1.8□□□□□ -2.7
DNF3Q12674 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-1.83□□□□□ -2.7
DNF3Q12674 YDR544CYDR544C 429 nt-1.85□□□□□ -2.71
DNF3Q12674 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-1.85□□□□□ -2.71
DNF3Q12674 JLP2YMR132C 627 nt-1.86□□□□□ -2.71
DNF3Q12674 YHR125WYHR125W 306 nt-1.86□□□□□ -2.71
DNF3Q12674 YAL066WYAL066W 309 nt-1.89□□□□□ -2.71
DNF3Q12674 YGL149WYGL149W 306 nt-1.9□□□□□ -2.71
DNF3Q12674 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-1.9□□□□□ -2.71
DNF3Q12674 snR54snR54 86 nt-1.9□□□□□ -2.71
DNF3Q12674 BI2Q0110 1272 nt-1.91□□□□□ -2.72
DNF3Q12674 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.92□□□□□ -2.72
DNF3Q12674 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-1.92□□□□□ -2.72
DNF3Q12674 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-1.93□□□□□ -2.72
DNF3Q12674 YNL266WYNL266W 420 nt-1.93□□□□□ -2.72
DNF3Q12674 HMRA1YCR097W 381 nt-1.95□□□□□ -2.72
DNF3Q12674 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.98□□□□□ -2.73
DNF3Q12674 snR81snR81 201 nt-1.99□□□□□ -2.73
DNF3Q12674 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-1.99□□□□□ -2.73
DNF3Q12674 CSN9YDR179C 489 nt-2.02□□□□□ -2.73
DNF3Q12674 YER006C-AYER006C-A 318 nt-2.02□□□□□ -2.73
DNF3Q12674 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.02□□□□□ -2.73
DNF3Q12674 snR50snR50 90 nt-2.04□□□□□ -2.74
DNF3Q12674 YML099W-AYML099W-A 330 nt-2.05□□□□□ -2.74
DNF3Q12674 snR77snR77 88 nt-2.06□□□□□ -2.74
DNF3Q12674 MPC1YGL080W 393 nt-2.06□□□□□ -2.74
DNF3Q12674 EAF6YJR082C 342 nt-2.06□□□□□ -2.74
DNF3Q12674 snR69snR69 101 nt-2.06□□□□□ -2.74
DNF3Q12674 YER137W-AYER137W-A 306 nt-2.06□□□□□ -2.74
DNF3Q12674 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-2.08□□□□□ -2.74
DNF3Q12674 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-2.09□□□□□ -2.74
DNF3Q12674 RDS3YPR094W 324 nt-2.09□□□□□ -2.74
DNF3Q12674 YML054C-AYML054C-A 159 nt-2.1□□□□□ -2.75
DNF3Q12674 YDR102CYDR102C 333 nt-2.11□□□□□ -2.75
DNF3Q12674 YNL205CYNL205C 423 nt-2.11□□□□□ -2.75
DNF3Q12674 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-2.12□□□□□ -2.75
DNF3Q12674 YDR543CYDR543C 300 nt-2.13□□□□□ -2.75
DNF3Q12674 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-2.13□□□□□ -2.75
DNF3Q12674 snR67snR67 82 nt-2.15□□□□□ -2.75
DNF3Q12674 YDL158CYDL158C 309 nt-2.15□□□□□ -2.75
DNF3Q12674 Q0142Q0142 177 nt-2.17□□□□□ -2.76
DNF3Q12674 YLR202CYLR202C 327 nt-2.17□□□□□ -2.76
DNF3Q12674 YER097WYER097W 330 nt-2.25□□□□□ -2.77
DNF3Q12674 snR39BsnR39B 96 nt-2.26□□□□□ -2.77
DNF3Q12674 YDR048CYDR048C 315 nt-2.27□□□□□ -2.77
DNF3Q12674 YFL032WYFL032W 321 nt-2.27□□□□□ -2.77
DNF3Q12674 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-2.28□□□□□ -2.77
DNF3Q12674 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-2.28□□□□□ -2.77
DNF3Q12674 YNL028WYNL028W 318 nt-2.28□□□□□ -2.77
DNF3Q12674 snR60snR60 104 nt-2.31□□□□□ -2.78
DNF3Q12674 YNL324WYNL324W 396 nt-2.31□□□□□ -2.78
DNF3Q12674 Q0255Q0255 1419 nt-2.32□□□□□ -2.78
DNF3Q12674 STE18YJR086W 333 nt-2.33□□□□□ -2.78
DNF3Q12674 YLR434CYLR434C 384 nt-2.33□□□□□ -2.78
DNF3Q12674 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-2.34□□□□□ -2.78
DNF3Q12674 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-2.34□□□□□ -2.78
DNF3Q12674 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-2.34□□□□□ -2.78
DNF3Q12674 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-2.34□□□□□ -2.78
DNF3Q12674 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-2.36□□□□□ -2.79
DNF3Q12674 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-2.39□□□□□ -2.79
DNF3Q12674 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-2.4□□□□□ -2.79
DNF3Q12674 YFL019CYFL019C 354 nt-2.41□□□□□ -2.8
DNF3Q12674 YKL123WYKL123W 381 nt-2.41□□□□□ -2.8
DNF3Q12674 snR41snR41 95 nt-2.43□□□□□ -2.8
DNF3Q12674 ATP6Q0085 780 nt-2.44□□□□□ -2.8
DNF3Q12674 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-2.45□□□□□ -2.8
DNF3Q12674 YNL122CYNL122C 348 nt-2.47□□□□□ -2.81
DNF3Q12674 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-2.47□□□□□ -2.81
DNF3Q12674 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-2.49□□□□□ -2.81
DNF3Q12674 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-2.5□□□□□ -2.81
DNF3Q12674 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-2.5□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.4 ms