Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 KAP120YPL125W 3099 nt1.53□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 CFT1YDR301W 4074 nt1.52□□□□□ -2.17 RIP-Chip
MSL5Q12186 EMC5YIL027C 426 nt1.52□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt1.52□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 YLR422WYLR422W 5799 nt1.51□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 MON2YNL297C 4911 nt1.51□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.51□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 CHS1YNL192W 3396 nt1.5□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 MEC1YBR136W 7107 nt1.5□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 RTP1YMR185W 2946 nt1.5□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 BIR1YJR089W 2865 nt1.49□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 PAN2YGL094C 3348 nt1.49□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 COG6YNL041C 2520 nt1.49□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 ALY2YJL084C 3141 nt1.49□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 STO1YMR125W 2586 nt1.48□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 snR62snR62 100 nt1.48□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 NOP9YJL010C 2001 nt1.47□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 snR190snR190 190 nt1.47□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 SXM1YDR395W 2835 nt1.47□□□□□ -2.17
MSL5Q12186 WAR1YML076C 2835 nt1.46□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 SEC1YDR164C 2175 nt1.46□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 SSK2YNR031C 4740 nt1.45□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 YLR041WYLR041W 321 nt1.45□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 VPS15YBR097W 4365 nt1.44□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 SET3YKR029C 2256 nt1.44□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 CAT8YMR280C 4302 nt1.44□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 RPL26BYGR034W 384 nt1.43□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.43□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 YGR130CYGR130C 2451 nt1.43□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 PIK1YNL267W 3201 nt1.42□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 BRR2YER172C 6492 nt1.42□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 KAP122YGL016W 3246 nt1.42□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt1.41□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 SKI3YPR189W 4299 nt1.41□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 RAD9YDR217C 3930 nt1.41□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 MSH3YCR092C 3057 nt1.41□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 APL3YBL037W 3078 nt1.41□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 SPC110YDR356W 2835 nt1.4□□□□□ -2.18
MSL5Q12186 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.4□□□□□ -2.19
MSL5Q12186 BEM3YPL115C 3387 nt1.38□□□□□ -2.19
MSL5Q12186 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt1.38□□□□□ -2.19
MSL5Q12186 PRP16YKR086W 3216 nt1.38□□□□□ -2.19
MSL5Q12186 FYV8YGR196C 2454 nt1.37□□□□□ -2.19
MSL5Q12186 KCS1YDR017C 3153 nt1.37□□□□□ -2.19
MSL5Q12186 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt1.36□□□□□ -2.19
MSL5Q12186 YDL073WYDL073W 2955 nt1.36□□□□□ -2.19
MSL5Q12186 UBP3YER151C 2739 nt1.35□□□□□ -2.19
MSL5Q12186 BST1YFL025C 3090 nt1.35□□□□□ -2.19
MSL5Q12186 PET127YOR017W 2403 nt1.35□□□□□ -2.19
MSL5Q12186 ASE1YOR058C 2658 nt1.35□□□□□ -2.19
MSL5Q12186 IRA1YBR140C 9279 nt1.33□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.33□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 CCH1YGR217W 6120 nt1.32□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 NUP188YML103C 4968 nt1.31□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 RPS26AYGL189C 360 nt1.31□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.31□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 PAU12YGR294W 363 nt1.31□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.31□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 PAU24YBR301W 363 nt1.31□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.3□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 SWI4YER111C 3282 nt1.3□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 LAA1YJL207C 6045 nt1.29□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 SEC10YLR166C 2616 nt1.29□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 HKR1YDR420W 5409 nt1.29□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 AZF1YOR113W 2745 nt1.28□□□□□ -2.2
MSL5Q12186 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.27□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 snR47snR47 99 nt1.27□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 SEC8YPR055W 3198 nt1.26□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 IML1YJR138W 4755 nt1.26□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.26□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.26□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.26□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.26□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.26□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.26□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.26□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 NNF2YGR089W 2811 nt1.26□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 TRM732YMR259C 4263 nt1.25□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 NUP145YGL092W 3954 nt1.24□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.23□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 MSN5YDR335W 3675 nt1.22□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.22□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 EST2YLR318W 2655 nt1.22□□□□□ -2.21
MSL5Q12186 MYO1YHR023W 5787 nt1.21□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 RPM2YML091C 3609 nt1.21□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.21□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 SEC3YER008C 4011 nt1.21□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 CLU1YMR012W 3834 nt1.2□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 GLG1YKR058W 1851 nt1.18□□□□□ -2.22 RIP-Chip
MSL5Q12186 ORC3YLL004W 1851 nt1.18□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 YSP1YHR155W 3687 nt1.18□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.18□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.17□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.17□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 CDC25YLR310C 4770 nt1.16□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 CDC39YCR093W 6327 nt1.15□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.15□□□□□ -2.22
MSL5Q12186 EST1YLR233C 2100 nt1.15□□□□□ -2.23
MSL5Q12186 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.15□□□□□ -2.23
MSL5Q12186 CSE1YGL238W 2883 nt1.14□□□□□ -2.23
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