Protein–RNA interactions for Protein: Q12149

RRP6, Exosome complex exonuclease RRP6, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP6Q12149 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.04□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 YML002WYML002W 2214 nt1.03□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.03□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 YNL337WYNL337W 255 nt1.03□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 RKR1YMR247C 4689 nt1.03□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 PRP16YKR086W 3216 nt1.03□□□□□ -2.24
RRP6Q12149 COX5BYIL111W 456 nt1.02□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 YDL073WYDL073W 2955 nt1.02□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 HAL9YOL089C 3093 nt1□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 YPR117WYPR117W 7470 nt1□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 UTP8YGR128C 2142 nt1□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 YJL182CYJL182C 318 nt1□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.99□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 YNL198CYNL198C 303 nt0.99□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 snR46snR46 197 nt0.99□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 FYV10YIL097W 1551 nt0.99□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 YJL150WYJL150W 303 nt0.98□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.98□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
RRP6Q12149 PRP42YDR235W 1635 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP6Q12149 CHS6YJL099W 2241 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP6Q12149 UTP20YBL004W 7482 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP6Q12149 YEL073CYEL073C 324 nt0.95□□□□□ -2.26
RRP6Q12149 PRP5YBR237W 2550 nt0.95□□□□□ -2.26
RRP6Q12149 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.93□□□□□ -2.26
RRP6Q12149 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.92□□□□□ -2.26
RRP6Q12149 QCR9YGR183C 201 nt0.92□□□□□ -2.26
RRP6Q12149 YLR041WYLR041W 321 nt0.91□□□□□ -2.26
RRP6Q12149 PRP39YML046W 1890 nt0.9□□□□□ -2.26
RRP6Q12149 SEC1YDR164C 2175 nt0.9□□□□□ -2.26
RRP6Q12149 YGR151CYGR151C 336 nt0.9□□□□□ -2.27
RRP6Q12149 TRS65YGR166W 1683 nt0.88□□□□□ -2.27
RRP6Q12149 TAH1YCR060W 336 nt0.87□□□□□ -2.27
RRP6Q12149 BEM3YPL115C 3387 nt0.86□□□□□ -2.27
RRP6Q12149 OST4YDL232W 111 nt0.86□□□□□ -2.27
RRP6Q12149 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.85□□□□□ -2.27
RRP6Q12149 YLR232WYLR232W 348 nt0.85□□□□□ -2.27
RRP6Q12149 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.84□□□□□ -2.27
RRP6Q12149 SNU13YEL026W 381 nt0.83□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 YGL182CYGL182C 324 nt0.83□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.83□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.83□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 YNL338WYNL338W 159 nt0.83□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.82□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.82□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 YMR160WYMR160W 2451 nt0.82□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 Q0032Q0032 291 nt0.81□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 YDR544CYDR544C 429 nt0.81□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 YOL014WYOL014W 375 nt0.81□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 LTE1YAL024C 4308 nt0.79□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.79□□□□□ -2.28
RRP6Q12149 YSP1YHR155W 3687 nt0.78□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 YOR225WYOR225W 330 nt0.76□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.75□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.74□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.74□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 PET111YMR257C 2403 nt0.73□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 YOR170WYOR170W 306 nt0.73□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 NNF2YGR089W 2811 nt0.72□□□□□ -2.29
RRP6Q12149 YOR102WYOR102W 351 nt0.71□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.71□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.7□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 BIR1YJR089W 2865 nt0.69□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 YLR294CYLR294C 330 nt0.69□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 YBL053WYBL053W 375 nt0.69□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 UTP10YJL109C 5310 nt0.69□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 COG6YNL041C 2520 nt0.68□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 SDH6YDR379C-A 240 nt0.68□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 snR48snR48 113 nt0.68□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.67□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.67□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.66□□□□□ -2.3
RRP6Q12149 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.65□□□□□ -2.31
RRP6Q12149 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.64□□□□□ -2.31
RRP6Q12149 GLG1YKR058W 1851 nt0.64□□□□□ -2.31
RRP6Q12149 MYO1YHR023W 5787 nt0.63□□□□□ -2.31
RRP6Q12149 SBH1YER087C-B 249 nt0.63□□□□□ -2.31
RRP6Q12149 YDR210WYDR210W 228 nt0.62□□□□□ -2.31
RRP6Q12149 MLP1YKR095W 5628 nt0.62□□□□□ -2.31
RRP6Q12149 CSE1YGL238W 2883 nt0.62□□□□□ -2.31
RRP6Q12149 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.61□□□□□ -2.31
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