Protein–RNA interactions for Protein: Q12094

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TSR3Q12094 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt3.17□□□□□ -1.9
TSR3Q12094 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt3.16□□□□□ -1.9
TSR3Q12094 MSH3YCR092C 3057 nt3.16□□□□□ -1.9
TSR3Q12094 UTP21YLR409C 2820 nt3.15□□□□□ -1.9
TSR3Q12094 STH1YIL126W 4080 nt3.15□□□□□ -1.91
TSR3Q12094 UTP22YGR090W 3714 nt3.14□□□□□ -1.91
TSR3Q12094 MOT1YPL082C 5604 nt3.14□□□□□ -1.91
TSR3Q12094 FYV8YGR196C 2454 nt3.13□□□□□ -1.91
TSR3Q12094 RAD50YNL250W 3939 nt3.13□□□□□ -1.91
TSR3Q12094 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.12□□□□□ -1.91
TSR3Q12094 HSL1YKL101W 4557 nt3.12□□□□□ -1.91
TSR3Q12094 ECM29YHL030W 5607 nt3.1□□□□□ -1.91
TSR3Q12094 YER090C-AYER090C-A 90 nt3.1□□□□□ -1.91
TSR3Q12094 DYN1YKR054C 12279 nt3.09□□□□□ -1.91
TSR3Q12094 HIR3YJR140C 4947 nt3.08□□□□□ -1.92
TSR3Q12094 SLH1YGR271W 5904 nt3.07□□□□□ -1.92
TSR3Q12094 ESL2YKR096W 3588 nt3.05□□□□□ -1.92
TSR3Q12094 SNQ2YDR011W 4506 nt3.03□□□□□ -1.92
TSR3Q12094 HER1YOR227W 3741 nt3.02□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 UBP2YOR124C 3819 nt3.01□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt3□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 ATG9YDL149W 2994 nt3□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 SPF1YEL031W 3648 nt3□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 UBR1YGR184C 5853 nt3□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 snR67snR67 82 nt3□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 GEA1YJR031C 4227 nt2.99□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 KAP122YGL016W 3246 nt2.97□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.97□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.97□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.97□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.97□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.97□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.97□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 TOM1YDR457W 9807 nt2.97□□□□□ -1.93
TSR3Q12094 SMC4YLR086W 4257 nt2.95□□□□□ -1.94
TSR3Q12094 CHC1YGL206C 4962 nt2.94□□□□□ -1.94
TSR3Q12094 BCK1YJL095W 4437 nt2.93□□□□□ -1.94
TSR3Q12094 PRP8YHR165C 7242 nt2.92□□□□□ -1.94
TSR3Q12094 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.92□□□□□ -1.94
TSR3Q12094 BNR1YIL159W 4128 nt2.92□□□□□ -1.94
TSR3Q12094 SAP1YER047C 2694 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YER138CYER138C 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YER160CYER160C 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YJR027WYJR027W 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YML039WYML039W 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YML045WYML045W 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YMR050CYMR050C 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.88□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 APL3YBL037W 3078 nt2.87□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YOL098CYOL098C 3114 nt2.86□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.86□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 NUP145YGL092W 3954 nt2.85□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 FLO11YIR019C 4104 nt2.84□□□□□ -1.95
TSR3Q12094 INO80YGL150C 4470 nt2.84□□□□□ -1.96
TSR3Q12094 FKS3YMR306W 5358 nt2.83□□□□□ -1.96
TSR3Q12094 CYR1YJL005W 6081 nt2.81□□□□□ -1.96
TSR3Q12094 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt2.81□□□□□ -1.96
TSR3Q12094 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
TSR3Q12094 NUM1YDR150W 8247 nt2.79□□□□□ -1.96
TSR3Q12094 TOP2YNL088W 4287 nt2.78□□□□□ -1.96
TSR3Q12094 NUP192YJL039C 5052 nt2.78□□□□□ -1.97
TSR3Q12094 KRE33YNL132W 3171 nt2.77□□□□□ -1.97
TSR3Q12094 snR70snR70 164 nt2.76□□□□□ -1.97
TSR3Q12094 snR77snR77 88 nt2.75□□□□□ -1.97
TSR3Q12094 PDR11YIL013C 4236 nt2.75□□□□□ -1.97
TSR3Q12094 SGS1YMR190C 4344 nt2.73□□□□□ -1.97
TSR3Q12094 RAV1YJR033C 4074 nt2.72□□□□□ -1.97
TSR3Q12094 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt2.7□□□□□ -1.98
TSR3Q12094 NEO1YIL048W 3456 nt2.69□□□□□ -1.98
TSR3Q12094 ESC1YMR219W 4977 nt2.69□□□□□ -1.98
TSR3Q12094 VPS13YLL040C 9435 nt2.66□□□□□ -1.98
TSR3Q12094 DNF1YER166W 4716 nt2.66□□□□□ -1.98
TSR3Q12094 SKI3YPR189W 4299 nt2.65□□□□□ -1.98
TSR3Q12094 SWI4YER111C 3282 nt2.64□□□□□ -1.99
TSR3Q12094 REV3YPL167C 4515 nt2.63□□□□□ -1.99
TSR3Q12094 YGR130CYGR130C 2451 nt2.63□□□□□ -1.99
TSR3Q12094 NUP188YML103C 4968 nt2.62□□□□□ -1.99
TSR3Q12094 CLU1YMR012W 3834 nt2.61□□□□□ -1.99
TSR3Q12094 YLR419WYLR419W 4308 nt2.6□□□□□ -1.99
TSR3Q12094 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt2.6□□□□□ -1.99
TSR3Q12094 CFT1YDR301W 4074 nt2.6□□□□□ -1.99
TSR3Q12094 BST1YFL025C 3090 nt2.6□□□□□ -1.99
TSR3Q12094 SOV1YMR066W 2697 nt2.59□□□□□ -2
TSR3Q12094 SEC31YDL195W 3822 nt2.59□□□□□ -2
TSR3Q12094 TOR1YJR066W 7413 nt2.57□□□□□ -2
TSR3Q12094 TRA1YHR099W 11235 nt2.55□□□□□ -2
TSR3Q12094 MYO4YAL029C 4416 nt2.54□□□□□ -2
TSR3Q12094 SPT7YBR081C 3999 nt2.54□□□□□ -2
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