Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.07□□□□□ -2.24
AVT5P38176 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.07□□□□□ -2.24
AVT5P38176 YML002WYML002W 2214 nt1.07□□□□□ -2.24
AVT5P38176 TAH1YCR060W 336 nt1.06□□□□□ -2.24
AVT5P38176 NST1YNL091W 3723 nt1.06□□□□□ -2.24
AVT5P38176 FYV10YIL097W 1551 nt1.05□□□□□ -2.24
AVT5P38176 QCR9YGR183C 201 nt1.05□□□□□ -2.24
AVT5P38176 RAD9YDR217C 3930 nt1.05□□□□□ -2.24
AVT5P38176 YJR029WYJR029W 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
AVT5P38176 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
AVT5P38176 NUP145YGL092W 3954 nt1.05□□□□□ -2.24
AVT5P38176 YDR544CYDR544C 429 nt1.04□□□□□ -2.24
AVT5P38176 snR190snR190 190 nt1.04□□□□□ -2.24
AVT5P38176 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.04□□□□□ -2.24
AVT5P38176 SCC2YDR180W 4482 nt1.04□□□□□ -2.24
AVT5P38176 STB6YKL072W 2301 nt1.04□□□□□ -2.24
AVT5P38176 CDC39YCR093W 6327 nt1.03□□□□□ -2.24
AVT5P38176 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.03□□□□□ -2.24
AVT5P38176 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.03□□□□□ -2.24
AVT5P38176 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.03□□□□□ -2.24
AVT5P38176 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.03□□□□□ -2.24
AVT5P38176 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.03□□□□□ -2.24
AVT5P38176 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.03□□□□□ -2.24
AVT5P38176 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.03□□□□□ -2.24
AVT5P38176 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.03□□□□□ -2.24
AVT5P38176 ROM2YLR371W 4071 nt1.03□□□□□ -2.24
AVT5P38176 SEC3YER008C 4011 nt1.02□□□□□ -2.25
AVT5P38176 LAA1YJL207C 6045 nt1.02□□□□□ -2.25
AVT5P38176 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.02□□□□□ -2.25
AVT5P38176 YBR099CYBR099C 384 nt1.02□□□□□ -2.25
AVT5P38176 RPL26BYGR034W 384 nt1.01□□□□□ -2.25
AVT5P38176 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.01□□□□□ -2.25
AVT5P38176 PMP2YEL017C-A 132 nt1□□□□□ -2.25
AVT5P38176 snR39BsnR39B 96 nt1□□□□□ -2.25
AVT5P38176 BEM2YER155C 6504 nt1□□□□□ -2.25
AVT5P38176 ASE1YOR058C 2658 nt0.99□□□□□ -2.25
AVT5P38176 SOM1YEL059C-A 225 nt0.99□□□□□ -2.25
AVT5P38176 OST4YDL232W 111 nt0.98□□□□□ -2.25
AVT5P38176 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.98□□□□□ -2.25
AVT5P38176 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.98□□□□□ -2.25
AVT5P38176 YLR232WYLR232W 348 nt0.98□□□□□ -2.25
AVT5P38176 MSH3YCR092C 3057 nt0.98□□□□□ -2.25
AVT5P38176 YLR041WYLR041W 321 nt0.96□□□□□ -2.26
AVT5P38176 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.96□□□□□ -2.26
AVT5P38176 PRP16YKR086W 3216 nt0.96□□□□□ -2.26
AVT5P38176 MYO1YHR023W 5787 nt0.95□□□□□ -2.26
AVT5P38176 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT5P38176 TFB5YDR079C-A 219 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT5P38176 YDR210WYDR210W 228 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT5P38176 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT5P38176 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT5P38176 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT5P38176 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT5P38176 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT5P38176 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT5P38176 YBL109WYBL109W 336 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT5P38176 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT5P38176 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT5P38176 CLU1YMR012W 3834 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT5P38176 SPT7YBR081C 3999 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT5P38176 BEM3YPL115C 3387 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT5P38176 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT5P38176 SEC8YPR055W 3198 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT5P38176 YDL073WYDL073W 2955 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT5P38176 COG6YNL041C 2520 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT5P38176 SIP4YJL089W 2490 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT5P38176 YMR326CYMR326C 309 nt0.86□□□□□ -2.27
AVT5P38176 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.86□□□□□ -2.27
AVT5P38176 YPR117WYPR117W 7470 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT5P38176 SEC1YDR164C 2175 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT5P38176 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT5P38176 UBP3YER151C 2739 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT5P38176 KAP120YPL125W 3099 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT5P38176 snR61snR61 90 nt0.84□□□□□ -2.27
AVT5P38176 ANS1YHR126C 480 nt0.84□□□□□ -2.27
AVT5P38176 YBR178WYBR178W 375 nt0.84□□□□□ -2.27
AVT5P38176 RCO1YMR075W 2055 nt0.83□□□□□ -2.28
AVT5P38176 RKR1YMR247C 4689 nt0.83□□□□□ -2.28
AVT5P38176 YGR130CYGR130C 2451 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT5P38176 STF2YGR008C 255 nt0.81□□□□□ -2.28
AVT5P38176 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.81□□□□□ -2.28
AVT5P38176 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.81□□□□□ -2.28
AVT5P38176 IML1YJR138W 4755 nt0.81□□□□□ -2.28
AVT5P38176 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.8□□□□□ -2.28
AVT5P38176 BIR1YJR089W 2865 nt0.79□□□□□ -2.28
AVT5P38176 YSP1YHR155W 3687 nt0.77□□□□□ -2.29
AVT5P38176 YNL266WYNL266W 420 nt0.77□□□□□ -2.29
AVT5P38176 YHR217CYHR217C 462 nt0.76□□□□□ -2.29
AVT5P38176 GLG1YKR058W 1851 nt0.74□□□□□ -2.29
AVT5P38176 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.74□□□□□ -2.29
AVT5P38176 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.74□□□□□ -2.29
AVT5P38176 CSE1YGL238W 2883 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT5P38176 NNF2YGR089W 2811 nt0.73□□□□□ -2.29
AVT5P38176 PAU24YBR301W 363 nt0.72□□□□□ -2.29
AVT5P38176 ULP2YIL031W 3105 nt0.7□□□□□ -2.3
AVT5P38176 HUG1YML058W-A 207 nt0.7□□□□□ -2.3
AVT5P38176 snR81snR81 201 nt0.68□□□□□ -2.3
AVT5P38176 SEC10YLR166C 2616 nt0.68□□□□□ -2.3
AVT5P38176 SBH1YER087C-B 249 nt0.67□□□□□ -2.3
AVT5P38176 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.67□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 136.3 ms