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Protein–RNA interactions for Protein: P20485
CKI1, Choline kinase, yeast
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582 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
CKI1
P20485
YOR345C
YOR345C
351 nt
0.41
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
ULP2
YIL031W
3105 nt
0.4
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
YCR022C
YCR022C
345 nt
0.4
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
tR(ACG)Q2
tR(ACG)Q2
74 nt
0.4
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
YLL019W-A
YLL019W-A
93 nt
0.4
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
YOR072W-B
YOR072W-B
162 nt
0.4
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
STE5
YDR103W
2754 nt
0.4
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
ULI1
YFR026C
510 nt
0.39
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
YGL123C-A
YGL123C-A
231 nt
0.39
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
YPR092W
YPR092W
306 nt
0.39
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
YOR161W-A
YOR161W-A
81 nt
0.38
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
AI1
Q0050
2505 nt
0.38
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
YLR120W-A
YLR120W-A
102 nt
0.37
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
YOR015W
YOR015W
360 nt
0.37
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
YOR192C-B
YOR192C-B
5313 nt
0.37
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
TRS65
YGR166W
1683 nt
0.37
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
RAD61
YDR014W
1944 nt
0.36
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
NNF2
YGR089W
2811 nt
0.36
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
ABF2
YMR072W
552 nt
0.35
□□□□□ -2.35
CKI1
P20485
YGR069W
YGR069W
336 nt
0.33
□□□□□ -2.36
CKI1
P20485
YLR041W
YLR041W
321 nt
0.33
□□□□□ -2.36
CKI1
P20485
YOR008C-A
YOR008C-A
225 nt
0.32
□□□□□ -2.36
CKI1
P20485
YHR131W-A
YHR131W-A
246 nt
0.31
□□□□□ -2.36
CKI1
P20485
YGL052W
YGL052W
306 nt
0.3
□□□□□ -2.36
CKI1
P20485
RPS26A
YGL189C
360 nt
0.3
□□□□□ -2.36
CKI1
P20485
BIR1
YJR089W
2865 nt
0.29
□□□□□ -2.36
CKI1
P20485
YDR371C-A
YDR371C-A
105 nt
0.29
□□□□□ -2.36
CKI1
P20485
YMR172C-A
YMR172C-A
384 nt
0.29
□□□□□ -2.36
CKI1
P20485
YDR366C
YDR366C
399 nt
0.28
□□□□□ -2.36
CKI1
P20485
SNU13
YEL026W
381 nt
0.28
□□□□□ -2.36
CKI1
P20485
NIP1
YMR309C
2439 nt
0.27
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
YNL054W-B
YNL054W-B
5250 nt
0.27
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
COX12
YLR038C
252 nt
0.27
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
YNL146W
YNL146W
303 nt
0.27
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
snR74
snR74
88 nt
0.26
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
ORC3
YLL004W
1851 nt
0.26
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
YLL006W-A
YLL006W-A
177 nt
0.25
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
YNL277W-A
YNL277W-A
189 nt
0.25
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
ESP1
YGR098C
4893 nt
0.24
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
YER053C-A
YER053C-A
114 nt
0.24
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
YDR524W-C
YDR524W-C
90 nt
0.22
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
YIL002W-A
YIL002W-A
210 nt
0.22
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0.22
□□□□□ -2.37
CKI1
P20485
RCO1
YMR075W
2055 nt
0.21
□□□□□ -2.38
CKI1
P20485
THO2
YNL139C
4794 nt
0.2
□□□□□ -2.38
CKI1
P20485
YOR186C-A
YOR186C-A
210 nt
0.2
□□□□□ -2.38
CKI1
P20485
YBR072C-A
YBR072C-A
162 nt
0.19
□□□□□ -2.38
CKI1
P20485
BUL2
YML111W
2763 nt
0.19
□□□□□ -2.38
CKI1
P20485
YER078W-A
YER078W-A
165 nt
0.18
□□□□□ -2.38
CKI1
P20485
UTP8
YGR128C
2142 nt
0.18
□□□□□ -2.38
CKI1
P20485
YBL100W-B
YBL100W-B
5313 nt
0.17
□□□□□ -2.38
CKI1
P20485
YCR038W-A
YCR038W-A
126 nt
0.17
□□□□□ -2.38
CKI1
P20485
snR65
snR65
100 nt
0.17
□□□□□ -2.38
CKI1
P20485
YIR030W-A
YIR030W-A
384 nt
0.17
□□□□□ -2.38
CKI1
P20485
YLR232W
YLR232W
348 nt
0.15
□□□□□ -2.39
CKI1
P20485
YBR182C-A
YBR182C-A
195 nt
0.14
□□□□□ -2.39
CKI1
P20485
YKU70
YMR284W
1809 nt
0.14
□□□□□ -2.39
CKI1
P20485
GLG1
YKR058W
1851 nt
0.12
□□□□□ -2.39
CKI1
P20485
YEL073C
YEL073C
324 nt
0.11
□□□□□ -2.39
CKI1
P20485
YPR010C-A
YPR010C-A
219 nt
0.11
□□□□□ -2.39
CKI1
P20485
APQ12
YIL040W
417 nt
0.1
□□□□□ -2.39
CKI1
P20485
tF(GAA)Q
tF(GAA)Q
75 nt
0.09
□□□□□ -2.4
CKI1
P20485
YMR158W-B
YMR158W-B
321 nt
0.09
□□□□□ -2.4
CKI1
P20485
snR49
snR49
165 nt
0.09
□□□□□ -2.4
CKI1
P20485
snR55
snR55
98 nt
0.08
□□□□□ -2.4
CKI1
P20485
YER181C
YER181C
324 nt
0.07
□□□□□ -2.4
CKI1
P20485
YML099W-A
YML099W-A
330 nt
0.06
□□□□□ -2.4
CKI1
P20485
TAH1
YCR060W
336 nt
0.05
□□□□□ -2.4
CKI1
P20485
CSE1
YGL238W
2883 nt
0.05
□□□□□ -2.4
CKI1
P20485
SDH6
YDR379C-A
240 nt
0.04
□□□□□ -2.4
CKI1
P20485
YGL041C
YGL041C
204 nt
0.03
□□□□□ -2.4
CKI1
P20485
YPL152W-A
YPL152W-A
99 nt
0.03
□□□□□ -2.4
CKI1
P20485
PRP39
YML046W
1890 nt
0.01
□□□□□ -2.41
CKI1
P20485
RPM2
YML091C
3609 nt
0
□□□□□ -2.41
CKI1
P20485
YOL155W-A
YOL155W-A
135 nt
0
□□□□□ -2.41
CKI1
P20485
YBR099C
YBR099C
384 nt
0
□□□□□ -2.41
CKI1
P20485
SOV1
YMR066W
2697 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
CKI1
P20485
YDR544C
YDR544C
429 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
CKI1
P20485
COG6
YNL041C
2520 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
CKI1
P20485
YBL039C-A
YBL039C-A
84 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
CKI1
P20485
YOR231C-A
YOR231C-A
201 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
CKI1
P20485
snR45
snR45
172 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
CKI1
P20485
YBR131C-A
YBR131C-A
90 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
CKI1
P20485
YGL182C
YGL182C
324 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
CKI1
P20485
Q0142
Q0142
177 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
CKI1
P20485
YOR314W-A
YOR314W-A
111 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
CKI1
P20485
YGL188C-A
YGL188C-A
141 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
CKI1
P20485
snR128
snR128
126 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
CKI1
P20485
EST1
YLR233C
2100 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
CKI1
P20485
YJL182C
YJL182C
318 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
CKI1
P20485
YEL014C
YEL014C
306 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
CKI1
P20485
snR8
snR8
190 nt
-0.14
□□□□□ -2.43
CKI1
P20485
YNL097C-B
YNL097C-B
123 nt
-0.14
□□□□□ -2.43
CKI1
P20485
YOR302W
YOR302W
78 nt
-0.16
□□□□□ -2.44
CKI1
P20485
YOR381W-A
YOR381W-A
168 nt
-0.18
□□□□□ -2.44
CKI1
P20485
TFB5
YDR079C-A
219 nt
-0.19
□□□□□ -2.44
CKI1
P20485
YOR170W
YOR170W
306 nt
-0.19
□□□□□ -2.44
CKI1
P20485
YDR210W
YDR210W
228 nt
-0.23
□□□□□ -2.45
CKI1
P20485
tM(CAU)Q2
tM(CAU)Q2
78 nt
-0.23
□□□□□ -2.45
CKI1
P20485
snR80
snR80
171 nt
-0.27
□□□□□ -2.45
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