Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms