Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Scn2aA0A0J9YTW6 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Scn2aA0A0J9YTW6 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Scn2aA0A0J9YTW6 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Scn2aA0A0J9YTW6 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Scn2aA0A0J9YTW6 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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