Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a4Q9QZR9 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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