Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a4Q9QZR9 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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