Protein–RNA interactions for Protein: Q8K467

Tmie, Transmembrane inner ear expressed protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmieQ8K467 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TmieQ8K467 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TmieQ8K467 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms