Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms