Protein–RNA interactions for Protein: Q12365

BBP1, Spindle pole component BBP1, yeastyeast

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BBP1Q12365 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.41□□□□□ -2.34
BBP1Q12365 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.41□□□□□ -2.34
BBP1Q12365 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.41□□□□□ -2.34
BBP1Q12365 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.41□□□□□ -2.34
BBP1Q12365 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.41□□□□□ -2.34
BBP1Q12365 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.41□□□□□ -2.34
BBP1Q12365 RPS25BYLR333C 327 nt0.41□□□□□ -2.34
BBP1Q12365 YNL211CYNL211C 261 nt0.41□□□□□ -2.34
BBP1Q12365 YPL225WYPL225W 441 nt0.41□□□□□ -2.34
BBP1Q12365 LEE1YPL054W 906 nt0.4□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 ULP2YIL031W 3105 nt0.4□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 SEC8YPR055W 3198 nt0.39□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.39□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 YAR029WYAR029W 225 nt0.39□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 TAR1YLR154W-C 375 nt0.39□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.39□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.38□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 YAR053WYAR053W 297 nt0.38□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 IQG1YPL242C 4488 nt0.38□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 PRP5YBR237W 2550 nt0.37□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.37□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.37□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.37□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 HTB2YBL002W 396 nt0.37□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 Q0144Q0144 330 nt0.36□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.36□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.36□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 RPL35AYDL191W 363 nt0.35□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 COX5BYIL111W 456 nt0.35□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 SGF11YPL047W 300 nt0.35□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 FMP27YLR454W 7887 nt0.35□□□□□ -2.35
BBP1Q12365 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.34□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.34□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.34□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 YMR321CYMR321C 318 nt0.34□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.34□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 OST4YDL232W 111 nt0.33□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 MLP1YKR095W 5628 nt0.33□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 PAU12YGR294W 363 nt0.32□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.32□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 PET111YMR257C 2403 nt0.32□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 ABF2YMR072W 552 nt0.31□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 snR190snR190 190 nt0.31□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 PRP42YDR235W 1635 nt0.31□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.3□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 QCR9YGR183C 201 nt0.3□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.3□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.3□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 BIL1YOR304C-A 231 nt0.3□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 AI1Q0050 2505 nt0.3□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 VIK1YPL253C 1944 nt0.29□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 SSS1YDR086C 243 nt0.29□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 SBH1YER087C-B 249 nt0.29□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 YGR035CYGR035C 351 nt0.29□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 YOL014WYOL014W 375 nt0.29□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 MLP2YIL149C 5040 nt0.28□□□□□ -2.36
BBP1Q12365 ESP1YGR098C 4893 nt0.27□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 TRS65YGR166W 1683 nt0.27□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 COG8YML071C 1824 nt0.27□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.26□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.26□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 YOR345CYOR345C 351 nt0.26□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 YDR048CYDR048C 315 nt0.25□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.25□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.24□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 RPS27BYHR021C 249 nt0.24□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.24□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 YDR157WYDR157W 402 nt0.23□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 VAR1Q0140 1197 nt0.23□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.23□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 BIR1YJR089W 2865 nt0.22□□□□□ -2.37
BBP1Q12365 YLR282CYLR282C 342 nt0.21□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 YCR022CYCR022C 345 nt0.2□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 YKL136WYKL136W 399 nt0.2□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.19□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 ULI1YFR026C 510 nt0.19□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 CSE2YNR010W 450 nt0.19□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.19□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 NNF2YGR089W 2811 nt0.19□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 RPS26AYGL189C 360 nt0.18□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 STE5YDR103W 2754 nt0.18□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.17□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.17□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.17□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 COY1YKL179C 2040 nt0.16□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 ORC3YLL004W 1851 nt0.16□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 BUL2YML111W 2763 nt0.16□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.16□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.16□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 RCO1YMR075W 2055 nt0.16□□□□□ -2.38
BBP1Q12365 NIP1YMR309C 2439 nt0.15□□□□□ -2.39
BBP1Q12365 HTL1YCR020W-B 237 nt0.15□□□□□ -2.39
BBP1Q12365 YLR041WYLR041W 321 nt0.14□□□□□ -2.39
BBP1Q12365 YNL146WYNL146W 303 nt0.14□□□□□ -2.39
BBP1Q12365 YPR092WYPR092W 306 nt0.14□□□□□ -2.39
BBP1Q12365 snR60snR60 104 nt0.12□□□□□ -2.39
BBP1Q12365 YDR102CYDR102C 333 nt0.12□□□□□ -2.39
BBP1Q12365 YFL063WYFL063W 456 nt0.12□□□□□ -2.39
BBP1Q12365 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.12□□□□□ -2.39
BBP1Q12365 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.12□□□□□ -2.39
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