Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YPL225WYPL225W 441 nt0.56□□□□□ -2.32
RRP42Q12277 SPO21YOL091W 1830 nt0.56□□□□□ -2.32
RRP42Q12277 PAA1YDR071C 576 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP42Q12277 VAR1Q0140 1197 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP42Q12277 TAR1YLR154W-C 375 nt0.55□□□□□ -2.32
RRP42Q12277 FYV10YIL097W 1551 nt0.54□□□□□ -2.32
RRP42Q12277 HTB2YBL002W 396 nt0.54□□□□□ -2.32
RRP42Q12277 YML002WYML002W 2214 nt0.54□□□□□ -2.32
RRP42Q12277 HAL9YOL089C 3093 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP42Q12277 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.53□□□□□ -2.32
RRP42Q12277 RPL26BYGR034W 384 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 YGR035CYGR035C 351 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 ULP2YIL031W 3105 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 UTP10YJL109C 5310 nt0.51□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 PRP5YBR237W 2550 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 YOR218CYOR218C 420 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.5□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 SSS1YDR086C 243 nt0.49□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 SGF11YPL047W 300 nt0.49□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 BEM3YPL115C 3387 nt0.49□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.48□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 YDR157WYDR157W 402 nt0.48□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 SEC8YPR055W 3198 nt0.47□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.47□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 BIL1YOR304C-A 231 nt0.47□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 FMP27YLR454W 7887 nt0.47□□□□□ -2.33
RRP42Q12277 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.46□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.46□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 YMR321CYMR321C 318 nt0.46□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.45□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.45□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.45□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 COG8YML071C 1824 nt0.45□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 OST4YDL232W 111 nt0.44□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.44□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 YDR048CYDR048C 315 nt0.43□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.42□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 COX5BYIL111W 456 nt0.41□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.41□□□□□ -2.34
RRP42Q12277 PRP42YDR235W 1635 nt0.4□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.4□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 PAU12YGR294W 363 nt0.4□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.4□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 ABF2YMR072W 552 nt0.4□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 YOR345CYOR345C 351 nt0.4□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 snR190snR190 190 nt0.4□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 ESP1YGR098C 4893 nt0.38□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.38□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 IQG1YPL242C 4488 nt0.37□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 YFL019CYFL019C 354 nt0.37□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 RPS27BYHR021C 249 nt0.37□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 PET111YMR257C 2403 nt0.37□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 SBH1YER087C-B 249 nt0.36□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 QCR9YGR183C 201 nt0.36□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 AI1Q0050 2505 nt0.36□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 VIK1YPL253C 1944 nt0.35□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.35□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.35□□□□□ -2.35
RRP42Q12277 HTL1YCR020W-B 237 nt0.34□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 YDR102CYDR102C 333 nt0.34□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.34□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 YAF9YNL107W 681 nt0.33□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 TRS65YGR166W 1683 nt0.33□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 YCR022CYCR022C 345 nt0.32□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 YOL014WYOL014W 375 nt0.32□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 YPR012WYPR012W 255 nt0.32□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 ULI1YFR026C 510 nt0.31□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 YLR282CYLR282C 342 nt0.31□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 MLP1YKR095W 5628 nt0.3□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 BIR1YJR089W 2865 nt0.3□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.28□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.28□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 YKL136WYKL136W 399 nt0.28□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 CSE2YNR010W 450 nt0.28□□□□□ -2.36
RRP42Q12277 BUL2YML111W 2763 nt0.27□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 COY1YKL179C 2040 nt0.27□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 snR60snR60 104 nt0.27□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 YPR092WYPR092W 306 nt0.27□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.27□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.26□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 RPS26AYGL189C 360 nt0.26□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 YLR041WYLR041W 321 nt0.26□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.26□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 YIL032CYIL032C 357 nt0.25□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 NNF2YGR089W 2811 nt0.25□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 RCO1YMR075W 2055 nt0.25□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 ORC3YLL004W 1851 nt0.24□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 MLP2YIL149C 5040 nt0.24□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 YFL063WYFL063W 456 nt0.24□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 YGR069WYGR069W 336 nt0.24□□□□□ -2.37
RRP42Q12277 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.24□□□□□ -2.37
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