Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 FIG4YNL325C 2640 nt1.55□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 YDL206WYDL206W 2289 nt1.55□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 LAA1YJL207C 6045 nt1.54□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 SSK2YNR031C 4740 nt1.54□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.54□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 MDS3YGL197W 4464 nt1.53□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.53□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 PRP39YML046W 1890 nt1.53□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 snR14snR14 160 nt1.53□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 YLL054CYLL054C 2532 nt1.52□□□□□ -2.17
LCB4Q12246 TRS65YGR166W 1683 nt1.52□□□□□ -2.17
LCB4Q12246 MMS4YBR098W 2076 nt1.52□□□□□ -2.17
LCB4Q12246 CCH1YGR217W 6120 nt1.52□□□□□ -2.17
LCB4Q12246 IRA1YBR140C 9279 nt1.51□□□□□ -2.17
LCB4Q12246 RPL33BYOR234C 324 nt1.5□□□□□ -2.17
LCB4Q12246 snR46snR46 197 nt1.5□□□□□ -2.17
LCB4Q12246 ALY2YJL084C 3141 nt1.49□□□□□ -2.17
LCB4Q12246 KCS1YDR017C 3153 nt1.48□□□□□ -2.17
LCB4Q12246 SMC1YFL008W 3678 nt1.48□□□□□ -2.17
LCB4Q12246 NUP145YGL092W 3954 nt1.48□□□□□ -2.17
LCB4Q12246 YGR130CYGR130C 2451 nt1.45□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 APL1YJR005W 2103 nt1.45□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 YAR009CYAR009C 3591 nt1.45□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.45□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 RPS30BYOR182C 192 nt1.45□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 PAN2YGL094C 3348 nt1.45□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 COY1YKL179C 2040 nt1.45□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 KAP122YGL016W 3246 nt1.45□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 PAA1YDR071C 576 nt1.44□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.44□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 SPC110YDR356W 2835 nt1.44□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 BST1YFL025C 3090 nt1.44□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 YOR019WYOR019W 2193 nt1.44□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 STO1YMR125W 2586 nt1.43□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 PMP1YCR024C-A 123 nt1.43□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 YEL073CYEL073C 324 nt1.43□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 POL5YEL055C 3069 nt1.43□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 YNL211CYNL211C 261 nt1.42□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 SET3YKR029C 2256 nt1.41□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.41□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 PET127YOR017W 2403 nt1.41□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 TTI1YKL033W 3117 nt1.41□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 TRM732YMR259C 4263 nt1.4□□□□□ -2.18
LCB4Q12246 HAL9YOL089C 3093 nt1.4□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.4□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.4□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.39□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 COX12YLR038C 252 nt1.39□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 RSM22YKL155C 1887 nt1.39□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.38□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.38□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 WAR1YML076C 2835 nt1.38□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 AZF1YOR113W 2745 nt1.38□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 NUP188YML103C 4968 nt1.37□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 SWI4YER111C 3282 nt1.37□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 IML1YJR138W 4755 nt1.37□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 GEA2YEL022W 4380 nt1.37□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 FYV8YGR196C 2454 nt1.37□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 EAF1YDR359C 2949 nt1.36□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 YCS4YLR272C 3531 nt1.36□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 APL3YBL037W 3078 nt1.36□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 PIK1YNL267W 3201 nt1.36□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 YPL044CYPL044C 549 nt1.36□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 EST2YLR318W 2655 nt1.34□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 CMC4YMR194C-B 222 nt1.34□□□□□ -2.19
LCB4Q12246 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.33□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.33□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.33□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.33□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.33□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.33□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.33□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.33□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.33□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.33□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 CLU1YMR012W 3834 nt1.33□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.32□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 PAU12YGR294W 363 nt1.32□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 PAU24YBR301W 363 nt1.32□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 HKR1YDR420W 5409 nt1.32□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 NOP9YJL010C 2001 nt1.32□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 Q0092Q0092 141 nt1.3□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.3□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 YLL020CYLL020C 306 nt1.3□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 NUP157YER105C 4176 nt1.29□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 YPR117WYPR117W 7470 nt1.29□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.29□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 CDC25YLR310C 4770 nt1.28□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.28□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 PRP5YBR237W 2550 nt1.28□□□□□ -2.2
LCB4Q12246 PRP42YDR235W 1635 nt1.27□□□□□ -2.21
LCB4Q12246 YLR282CYLR282C 342 nt1.27□□□□□ -2.21
LCB4Q12246 UTP8YGR128C 2142 nt1.27□□□□□ -2.21
LCB4Q12246 MSN5YDR335W 3675 nt1.25□□□□□ -2.21
LCB4Q12246 RPL26BYGR034W 384 nt1.25□□□□□ -2.21
LCB4Q12246 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.25□□□□□ -2.21
LCB4Q12246 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.25□□□□□ -2.21
LCB4Q12246 COX5BYIL111W 456 nt1.25□□□□□ -2.21
LCB4Q12246 CDC39YCR093W 6327 nt1.24□□□□□ -2.21
LCB4Q12246 ATP8Q0080 147 nt1.24□□□□□ -2.21
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