Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 CTF4YPR135W 2784 nt2.08□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 UBP2YOR124C 3819 nt2.08□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 POL5YEL055C 3069 nt2.08□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 MYO2YOR326W 4725 nt2.07□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.07□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 PAN2YGL094C 3348 nt2.07□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 SKI3YPR189W 4299 nt2.07□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 UFD2YDL190C 2886 nt2.07□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 KCS1YDR017C 3153 nt2.06□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.06□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 YNL211CYNL211C 261 nt2.06□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 GYP5YPL249C 2685 nt2.05□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 KIP1YBL063W 3336 nt2.05□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 SLX4YLR135W 2247 nt2.05□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 SPP41YDR464W 4308 nt2.04□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 DGR1YNL130C-A 147 nt2.04□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 MMS4YBR098W 2076 nt2.04□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 SMC4YLR086W 4257 nt2.03□□□□□ -2.08
MCD1Q12158 COA6YMR244C-A 315 nt2.02□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.02□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 snR14snR14 160 nt2.02□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 PRP5YBR237W 2550 nt2.01□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 SEC31YDL195W 3822 nt2.01□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 YJL022WYJL022W 309 nt2.01□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 MON2YNL297C 4911 nt2□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 YAR009CYAR009C 3591 nt2□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 YCS4YLR272C 3531 nt2□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.98□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 CDC31YOR257W 486 nt1.98□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 RSM22YKL155C 1887 nt1.97□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.97□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.97□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 YLL054CYLL054C 2532 nt1.97□□□□□ -2.09
MCD1Q12158 KAP122YGL016W 3246 nt1.96□□□□□ -2.1
MCD1Q12158 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.95□□□□□ -2.1
MCD1Q12158 YOR019WYOR019W 2193 nt1.95□□□□□ -2.1
MCD1Q12158 NEO1YIL048W 3456 nt1.94□□□□□ -2.1
MCD1Q12158 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.94□□□□□ -2.1
MCD1Q12158 YLR422WYLR422W 5799 nt1.92□□□□□ -2.1
MCD1Q12158 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.92□□□□□ -2.1
MCD1Q12158 DNF3YMR162C 4971 nt1.92□□□□□ -2.1
MCD1Q12158 BFR2YDR299W 1605 nt1.91□□□□□ -2.1
MCD1Q12158 SMC1YFL008W 3678 nt1.9□□□□□ -2.1
MCD1Q12158 YGL182CYGL182C 324 nt1.9□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.9□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.9□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 SET3YKR029C 2256 nt1.9□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 STO1YMR125W 2586 nt1.9□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 YOR093CYOR093C 4947 nt1.89□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 UTP8YGR128C 2142 nt1.89□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.89□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 COX5BYIL111W 456 nt1.89□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 YLL020CYLL020C 306 nt1.89□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 CMC4YMR194C-B 222 nt1.88□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 PKH3YDR466W 2697 nt1.88□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 PEP1YBL017C 4740 nt1.87□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 YLR282CYLR282C 342 nt1.87□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.87□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 TRM732YMR259C 4263 nt1.86□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 FIG2YCR089W 4830 nt1.86□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 MEC1YBR136W 7107 nt1.86□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 NOP9YJL010C 2001 nt1.86□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 EAF1YDR359C 2949 nt1.86□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 CHS6YJL099W 2241 nt1.86□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 PMD1YER132C 5262 nt1.85□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.84□□□□□ -2.11
MCD1Q12158 SWI4YER111C 3282 nt1.83□□□□□ -2.12
MCD1Q12158 WAR1YML076C 2835 nt1.83□□□□□ -2.12
MCD1Q12158 STB6YKL072W 2301 nt1.83□□□□□ -2.12
MCD1Q12158 NUP157YER105C 4176 nt1.83□□□□□ -2.12
MCD1Q12158 APL3YBL037W 3078 nt1.82□□□□□ -2.12
MCD1Q12158 YML002WYML002W 2214 nt1.82□□□□□ -2.12
MCD1Q12158 BST1YFL025C 3090 nt1.81□□□□□ -2.12
MCD1Q12158 VPS15YBR097W 4365 nt1.8□□□□□ -2.12
MCD1Q12158 IRC20YLR247C 4671 nt1.8□□□□□ -2.12
MCD1Q12158 TAH1YCR060W 336 nt1.79□□□□□ -2.12
MCD1Q12158 YLR041WYLR041W 321 nt1.78□□□□□ -2.12
MCD1Q12158 OST4YDL232W 111 nt1.77□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.77□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 NUP188YML103C 4968 nt1.77□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 ASE1YOR058C 2658 nt1.76□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 GEA2YEL022W 4380 nt1.76□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.76□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 snR190snR190 190 nt1.76□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.76□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 CFT1YDR301W 4074 nt1.76□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 SEC3YER008C 4011 nt1.75□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 NUP145YGL092W 3954 nt1.75□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 RTP1YMR185W 2946 nt1.75□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 RPL26BYGR034W 384 nt1.75□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 YBR099CYBR099C 384 nt1.75□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 SEC21YNL287W 2808 nt1.74□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 FYV10YIL097W 1551 nt1.74□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.74□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 IRA1YBR140C 9279 nt1.73□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.73□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 AZF1YOR113W 2745 nt1.73□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 EST2YLR318W 2655 nt1.72□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 QCR9YGR183C 201 nt1.72□□□□□ -2.13
MCD1Q12158 ANS1YHR126C 480 nt1.71□□□□□ -2.14
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