Protein–RNA interactions for Protein: Q12094

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TSR3Q12094 SYH1YPL105C 2550 nt3.62□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.62□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.62□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.62□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.62□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.62□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.62□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.62□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.6□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 TCB2YNL087W 3537 nt3.6□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 CTR9YOL145C 3234 nt3.59□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 VAS1YGR094W 3315 nt3.59□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 ENA5YDR038C 3276 nt3.58□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 ENA2YDR039C 3276 nt3.58□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 ENA1YDR040C 3276 nt3.58□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 DGR1YNL130C-A 147 nt3.58□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 STO1YMR125W 2586 nt3.58□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 DRS2YAL026C 4068 nt3.58□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 CSR2YPR030W 3366 nt3.57□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 TOF1YNL273W 3717 nt3.56□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 NUP100YKL068W 2880 nt3.56□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 INP51YIL002C 2841 nt3.56□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 YIL169CYIL169C 2988 nt3.55□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 GYP5YPL249C 2685 nt3.55□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 ECM21YBL101C 3354 nt3.55□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 YOR296WYOR296W 3870 nt3.55□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 NMD2YHR077C 3270 nt3.54□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 TFC3YAL001C 3483 nt3.54□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 SEC3YER008C 4011 nt3.54□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 STU1YBL034C 4542 nt3.54□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 SXM1YDR395W 2835 nt3.53□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt3.53□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 POL2YNL262W 6669 nt3.53□□□□□ -1.84
TSR3Q12094 MSH6YDR097C 3729 nt3.52□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 CSE1YGL238W 2883 nt3.52□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 RSE1YML049C 4086 nt3.51□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 MYO3YKL129C 3819 nt3.51□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.51□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 YBT1YLL048C 4986 nt3.5□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 ULP2YIL031W 3105 nt3.5□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 NAB6YML117W 3405 nt3.49□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 ESL1YIL151C 3357 nt3.49□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 SEC8YPR055W 3198 nt3.48□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 MET18YIL128W 3099 nt3.47□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 YAR009CYAR009C 3591 nt3.47□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.47□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.47□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 PAU10YDR542W 363 nt3.47□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 PAU4YLR461W 363 nt3.47□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 NUT1YGL151W 3399 nt3.46□□□□□ -1.85
TSR3Q12094 SSN2YDR443C 4263 nt3.45□□□□□ -1.86
TSR3Q12094 TAO3YIL129C 7131 nt3.44□□□□□ -1.86
TSR3Q12094 SIN3YOL004W 4611 nt3.44□□□□□ -1.86
TSR3Q12094 RPN1YHR027C 2982 nt3.43□□□□□ -1.86
TSR3Q12094 SPO14YKR031C 5052 nt3.42□□□□□ -1.86
TSR3Q12094 YEF3YLR249W 3135 nt3.42□□□□□ -1.86
TSR3Q12094 YSP2YDR326C 4317 nt3.42□□□□□ -1.86
TSR3Q12094 IRE1YHR079C 3348 nt3.41□□□□□ -1.86
TSR3Q12094 SSD1YDR293C 3753 nt3.4□□□□□ -1.86
TSR3Q12094 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt3.4□□□□□ -1.87
TSR3Q12094 RGC1YPR115W 3252 nt3.4□□□□□ -1.87
TSR3Q12094 TDA9YML081W 3756 nt3.4□□□□□ -1.87
TSR3Q12094 MSB1YOR188W 3414 nt3.35□□□□□ -1.87
TSR3Q12094 ILS1YBL076C 3219 nt3.35□□□□□ -1.87
TSR3Q12094 YMR160WYMR160W 2451 nt3.35□□□□□ -1.87
TSR3Q12094 YSP1YHR155W 3687 nt3.34□□□□□ -1.87
TSR3Q12094 KIP1YBL063W 3336 nt3.34□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 STT4YLR305C 5703 nt3.33□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 FAR11YNL127W 2862 nt3.32□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 YCS4YLR272C 3531 nt3.32□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 MSB2YGR014W 3921 nt3.31□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 CDC25YLR310C 4770 nt3.31□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.3□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.3□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.3□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.3□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 PAU12YGR294W 363 nt3.3□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt3.29□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 PRP16YKR086W 3216 nt3.29□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 MLP2YIL149C 5040 nt3.28□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 HUG1YML058W-A 207 nt3.28□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 SIR4YDR227W 4077 nt3.28□□□□□ -1.88
TSR3Q12094 YLR422WYLR422W 5799 nt3.27□□□□□ -1.89
TSR3Q12094 SRB8YCR081W 4284 nt3.27□□□□□ -1.89
TSR3Q12094 YPL216WYPL216W 3309 nt3.27□□□□□ -1.89
TSR3Q12094 KOG1YHR186C 4674 nt3.25□□□□□ -1.89
TSR3Q12094 AMS1YGL156W 3252 nt3.24□□□□□ -1.89
TSR3Q12094 GIP3YPL137C 3831 nt3.24□□□□□ -1.89
TSR3Q12094 RPA190YOR341W 4995 nt3.23□□□□□ -1.89
TSR3Q12094 AXL1YPR122W 3627 nt3.21□□□□□ -1.89
TSR3Q12094 FLO1YAR050W 4614 nt3.21□□□□□ -1.89
TSR3Q12094 SEC7YDR170C 6030 nt3.21□□□□□ -1.9
TSR3Q12094 PET309YLR067C 2898 nt3.21□□□□□ -1.9
TSR3Q12094 MSN5YDR335W 3675 nt3.21□□□□□ -1.9
TSR3Q12094 IRC20YLR247C 4671 nt3.2□□□□□ -1.9
TSR3Q12094 RIF1YBR275C 5751 nt3.19□□□□□ -1.9
TSR3Q12094 GEA2YEL022W 4380 nt3.19□□□□□ -1.9
TSR3Q12094 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt3.19□□□□□ -1.9
TSR3Q12094 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt3.18□□□□□ -1.9
TSR3Q12094 DNA2YHR164C 4569 nt3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 199.8 ms