Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MitfQ08874 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MitfQ08874 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MitfQ08874 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms