Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 BCK1YJL095W 4437 nt2.62□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 TRS130YMR218C 3309 nt2.62□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.61□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.61□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.61□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.61□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.61□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.61□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 PET309YLR067C 2898 nt2.6□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.6□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt2.6□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 ESL2YKR096W 3588 nt2.59□□□□□ -1.99
BUD20Q08004 TOF1YNL273W 3717 nt2.59□□□□□ -2
BUD20Q08004 TRL1YJL087C 2484 nt2.58□□□□□ -2
BUD20Q08004 UBP3YER151C 2739 nt2.58□□□□□ -2
BUD20Q08004 RGA1YOR127W 3024 nt2.57□□□□□ -2
BUD20Q08004 SPO24YPR036W-A 204 nt2.57□□□□□ -2
BUD20Q08004 PDR1YGL013C 3207 nt2.57□□□□□ -2
BUD20Q08004 PAN2YGL094C 3348 nt2.57□□□□□ -2
BUD20Q08004 SYH1YPL105C 2550 nt2.56□□□□□ -2
BUD20Q08004 SAP1YER047C 2694 nt2.56□□□□□ -2
BUD20Q08004 TOM1YDR457W 9807 nt2.56□□□□□ -2
BUD20Q08004 PRP8YHR165C 7242 nt2.56□□□□□ -2
BUD20Q08004 WAR1YML076C 2835 nt2.55□□□□□ -2
BUD20Q08004 RPL26BYGR034W 384 nt2.55□□□□□ -2
BUD20Q08004 GYP5YPL249C 2685 nt2.55□□□□□ -2
BUD20Q08004 FLO11YIR019C 4104 nt2.54□□□□□ -2
BUD20Q08004 UBR1YGR184C 5853 nt2.54□□□□□ -2
BUD20Q08004 SRB8YCR081W 4284 nt2.54□□□□□ -2
BUD20Q08004 AZF1YOR113W 2745 nt2.54□□□□□ -2
BUD20Q08004 YOR055WYOR055W 435 nt2.53□□□□□ -2
BUD20Q08004 SFB2YNL049C 2631 nt2.53□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 SLN1YIL147C 3663 nt2.52□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 DNA2YHR164C 4569 nt2.52□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 SSD1YDR293C 3753 nt2.52□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 NAB6YML117W 3405 nt2.5□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 ARP8YOR141C 2646 nt2.5□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 YDR209CYDR209C 414 nt2.5□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 FKS3YMR306W 5358 nt2.5□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 CHC1YGL206C 4962 nt2.5□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 ROM2YLR371W 4071 nt2.49□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 snR190snR190 190 nt2.49□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 NUT1YGL151W 3399 nt2.49□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 CYR1YJL005W 6081 nt2.49□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 PIK1YNL267W 3201 nt2.49□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 YAR009CYAR009C 3591 nt2.48□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 CHS1YNL192W 3396 nt2.48□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt2.48□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 YDL073WYDL073W 2955 nt2.48□□□□□ -2.01
BUD20Q08004 TRA1YHR099W 11235 nt2.46□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.46□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 snR70snR70 164 nt2.45□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt2.45□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 NNF2YGR089W 2811 nt2.45□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 NUM1YDR150W 8247 nt2.45□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 GEA1YJR031C 4227 nt2.44□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 ESC1YMR219W 4977 nt2.44□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 UTP21YLR409C 2820 nt2.44□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 GIP3YPL137C 3831 nt2.44□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 MSB1YOR188W 3414 nt2.43□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 FAR11YNL127W 2862 nt2.42□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 HIR3YJR140C 4947 nt2.42□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt2.42□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 ANS1YHR126C 480 nt2.42□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 TDA9YML081W 3756 nt2.42□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 BEM3YPL115C 3387 nt2.42□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 MGA2YIR033W 3342 nt2.42□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 RTT101YJL047C 2529 nt2.41□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 SKI7YOR076C 2244 nt2.41□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 RAD50YNL250W 3939 nt2.4□□□□□ -2.02
BUD20Q08004 BRE1YDL074C 2103 nt2.4□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.4□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 SGS1YMR190C 4344 nt2.4□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 RPL41AYDL184C 78 nt2.39□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 BNR1YIL159W 4128 nt2.38□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 TOR1YJR066W 7413 nt2.38□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 KIP1YBL063W 3336 nt2.38□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 PDR11YIL013C 4236 nt2.37□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 RAV1YJR033C 4074 nt2.37□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 TOP2YNL088W 4287 nt2.35□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.35□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt2.35□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 EMC5YIL027C 426 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YER138CYER138C 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YER160CYER160C 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YJR027WYJR027W 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YML039WYML039W 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YML045WYML045W 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YMR050CYMR050C 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
BUD20Q08004 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58 ms