Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 YKL118WYKL118W 312 nt0.69□□□□□ -2.3
SYF2P53277 RKR1YMR247C 4689 nt0.69□□□□□ -2.3
SYF2P53277 COG8YML071C 1824 nt0.68□□□□□ -2.3
SYF2P53277 BFR2YDR299W 1605 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 snR60snR60 104 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 YDR413CYDR413C 576 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 YER097WYER097W 330 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 ALG13YGL047W 609 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 IES4YOR189W 351 nt0.67□□□□□ -2.3
SYF2P53277 ASE1YOR058C 2658 nt0.66□□□□□ -2.3
SYF2P53277 PAU12YGR294W 363 nt0.66□□□□□ -2.3
SYF2P53277 SGF11YPL047W 300 nt0.66□□□□□ -2.3
SYF2P53277 ISD11YER048W-A 285 nt0.65□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.65□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YIL032CYIL032C 357 nt0.65□□□□□ -2.31
SYF2P53277 CMC4YMR194C-B 222 nt0.65□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YMR321CYMR321C 318 nt0.65□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YNL211CYNL211C 261 nt0.65□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.65□□□□□ -2.31
SYF2P53277 VIK1YPL253C 1944 nt0.65□□□□□ -2.31
SYF2P53277 NOP9YJL010C 2001 nt0.64□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YGL149WYGL149W 306 nt0.64□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.64□□□□□ -2.31
SYF2P53277 RPS27BYHR021C 249 nt0.63□□□□□ -2.31
SYF2P53277 PRP16YKR086W 3216 nt0.63□□□□□ -2.31
SYF2P53277 STE5YDR103W 2754 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YKL136WYKL136W 399 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YMR160WYMR160W 2451 nt0.62□□□□□ -2.31
SYF2P53277 PMP1YCR024C-A 123 nt0.61□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.61□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YOR282WYOR282W 321 nt0.61□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YPL044CYPL044C 549 nt0.61□□□□□ -2.31
SYF2P53277 CSE2YNR010W 450 nt0.6□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YOR015WYOR015W 360 nt0.6□□□□□ -2.31
SYF2P53277 MYO1YHR023W 5787 nt0.59□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.59□□□□□ -2.31
SYF2P53277 YOR218CYOR218C 420 nt0.59□□□□□ -2.31
SYF2P53277 QCR9YGR183C 201 nt0.58□□□□□ -2.32
SYF2P53277 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.58□□□□□ -2.32
SYF2P53277 RPL39YJL189W 156 nt0.58□□□□□ -2.32
SYF2P53277 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.58□□□□□ -2.32
SYF2P53277 PAA1YDR071C 576 nt0.57□□□□□ -2.32
SYF2P53277 Q0142Q0142 177 nt0.57□□□□□ -2.32
SYF2P53277 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.57□□□□□ -2.32
SYF2P53277 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.56□□□□□ -2.32
SYF2P53277 YNL028WYNL028W 318 nt0.56□□□□□ -2.32
SYF2P53277 CHS6YJL099W 2241 nt0.56□□□□□ -2.32
SYF2P53277 RPL26BYGR034W 384 nt0.55□□□□□ -2.32
SYF2P53277 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.55□□□□□ -2.32
SYF2P53277 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.55□□□□□ -2.32
SYF2P53277 RAD61YDR014W 1944 nt0.55□□□□□ -2.32
SYF2P53277 NPR2YEL062W 1848 nt0.54□□□□□ -2.32
SYF2P53277 YOL014WYOL014W 375 nt0.54□□□□□ -2.32
SYF2P53277 LTE1YAL024C 4308 nt0.54□□□□□ -2.32
SYF2P53277 UTP10YJL109C 5310 nt0.53□□□□□ -2.32
SYF2P53277 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.53□□□□□ -2.32
SYF2P53277 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.53□□□□□ -2.32
SYF2P53277 YGR069WYGR069W 336 nt0.52□□□□□ -2.33
SYF2P53277 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.52□□□□□ -2.33
SYF2P53277 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.52□□□□□ -2.33
SYF2P53277 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.52□□□□□ -2.33
SYF2P53277 snR190snR190 190 nt0.52□□□□□ -2.33
SYF2P53277 FYV10YIL097W 1551 nt0.52□□□□□ -2.33
SYF2P53277 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.51□□□□□ -2.33
SYF2P53277 YML002WYML002W 2214 nt0.51□□□□□ -2.33
SYF2P53277 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.51□□□□□ -2.33
SYF2P53277 BIR1YJR089W 2865 nt0.5□□□□□ -2.33
SYF2P53277 PRP5YBR237W 2550 nt0.5□□□□□ -2.33
SYF2P53277 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.5□□□□□ -2.33
SYF2P53277 snR74snR74 88 nt0.5□□□□□ -2.33
SYF2P53277 YPR092WYPR092W 306 nt0.5□□□□□ -2.33
SYF2P53277 COY1YKL179C 2040 nt0.5□□□□□ -2.33
SYF2P53277 SEC8YPR055W 3198 nt0.49□□□□□ -2.33
SYF2P53277 YGL052WYGL052W 306 nt0.49□□□□□ -2.33
SYF2P53277 COX5BYIL111W 456 nt0.49□□□□□ -2.33
SYF2P53277 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.49□□□□□ -2.33
SYF2P53277 YLR282CYLR282C 342 nt0.48□□□□□ -2.33
SYF2P53277 YNL146WYNL146W 303 nt0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 100.3 ms