Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Epb41P48193 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 621.2 ms