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Protein–RNA interactions for Protein: P40077
DSE1, Protein DSE1, yeast
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573 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
DSE1
P40077
IES4
YOR189W
351 nt
0.74
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
BUD3
YCL014W
4911 nt
0.74
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
SSS1
YDR086C
243 nt
0.73
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
YDR102C
YDR102C
333 nt
0.73
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
YDR344C
YDR344C
444 nt
0.73
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
tF(GAA)B
tF(GAA)B
73 nt
0.73
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
tF(GAA)F
tF(GAA)F
73 nt
0.73
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
tF(GAA)G
tF(GAA)G
73 nt
0.73
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
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0.73
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
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DSE1
P40077
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tF(GAA)M
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DSE1
P40077
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tF(GAA)P1
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DSE1
P40077
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tF(GAA)P2
73 nt
0.73
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
YPL044C
YPL044C
549 nt
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□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
SPO21
YOL091W
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0.73
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
snR56
snR56
88 nt
0.72
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
GIM4
YEL003W
336 nt
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□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
YHR175W-A
YHR175W-A
150 nt
0.72
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
MCM10
YIL150C
1716 nt
0.72
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
YDL240C-A
YDL240C-A
138 nt
0.71
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
YMR321C
YMR321C
318 nt
0.71
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
NOP9
YJL010C
2001 nt
0.71
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
QCR9
YGR183C
201 nt
0.7
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
PAU12
YGR294W
363 nt
0.7
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
YIL115W-A
YIL115W-A
372 nt
0.7
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
YPL225W
YPL225W
441 nt
0.7
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
RKR1
YMR247C
4689 nt
0.7
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
BFR2
YDR299W
1605 nt
0.69
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
PMP1
YCR024C-A
123 nt
0.69
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
PAA1
YDR071C
576 nt
0.69
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
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YMR272W-A
114 nt
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□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
HTL1
YCR020W-B
237 nt
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□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
SGF11
YPL047W
300 nt
0.68
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
snR36
snR36
182 nt
0.68
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
YHR063W-A
YHR063W-A
336 nt
0.67
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
YNL211C
YNL211C
261 nt
0.67
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
COG8
YML071C
1824 nt
0.66
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
YPR159C-A
YPR159C-A
102 nt
0.66
□□□□□ -2.3
DSE1
P40077
snR60
snR60
104 nt
0.65
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
YDR183C-A
YDR183C-A
258 nt
0.65
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
RPL26B
YGR034W
384 nt
0.65
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
tR(ACG)Q2
tR(ACG)Q2
74 nt
0.65
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
RPS27B
YHR021C
249 nt
0.65
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
YIL032C
YIL032C
357 nt
0.65
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
CSE2
YNR010W
450 nt
0.65
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
YOR218C
YOR218C
420 nt
0.65
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
VIK1
YPL253C
1944 nt
0.64
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
ATP6
Q0085
780 nt
0.63
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
YGL149W
YGL149W
306 nt
0.63
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
NPR2
YEL062W
1848 nt
0.62
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
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YFL032W
321 nt
0.62
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
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YFR012W-A
87 nt
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□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
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YMR193C-A
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DSE1
P40077
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YFL063W
456 nt
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□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
YKL118W
YKL118W
312 nt
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□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
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YMR031W-A
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DSE1
P40077
FMP27
YLR454W
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0.6
□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
ASE1
YOR058C
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□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
ULP2
YIL031W
3105 nt
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DSE1
P40077
CHS6
YJL099W
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□□□□□ -2.31
DSE1
P40077
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YDR413C
576 nt
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DSE1
P40077
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YKL136W
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DSE1
P40077
IQG1
YPL242C
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DSE1
P40077
BEM3
YPL115C
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DSE1
P40077
RPL39
YJL189W
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DSE1
P40077
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YAL067W-A
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DSE1
P40077
SEC8
YPR055W
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DSE1
P40077
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YCR018C-A
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DSE1
P40077
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YDL185C-A
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DSE1
P40077
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YDR354C-A
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DSE1
P40077
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YER097W
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YNL028W
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YOL014W
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YML002W
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YSP1
YHR155W
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YLR399W-A
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YPR160W-A
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P40077
STE5
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YJL026C-A
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FYV10
YIL097W
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YMR307C-A
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P40077
snR190
snR190
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P40077
UTP10
YJL109C
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P40077
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YJL197C-A
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90 nt
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DSE1
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YEL020C-B
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DSE1
P40077
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YJL127W-A
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□□□□□ -2.33
DSE1
P40077
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YIL149C
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DSE1
P40077
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YBR237W
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DSE1
P40077
YIL134C-A
YIL134C-A
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DSE1
P40077
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YLL019W-A
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DSE1
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RAD61
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1944 nt
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DSE1
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YLR120W-A
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0.48
□□□□□ -2.33
DSE1
P40077
YLR282C
YLR282C
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0.48
□□□□□ -2.33
DSE1
P40077
YOR015W
YOR015W
360 nt
0.48
□□□□□ -2.33
DSE1
P40077
YOR072W-B
YOR072W-B
162 nt
0.48
□□□□□ -2.33
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