Protein–RNA interactions for Protein: P38842

YHR140W, UPF0641 membrane protein YHR140W, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WP38842 YER084W-AYER084W-A 513 nt-0.19□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YPR092WYPR092W 306 nt-0.19□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 AIM29YKR074W 468 nt-0.2□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YNL319WYNL319W 441 nt-0.2□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.2□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.2□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 snR45snR45 172 nt-0.2□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YKU70YMR284W 1809 nt-0.2□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 ZEO1YOL109W 342 nt-0.21□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YPL225WYPL225W 441 nt-0.21□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 PCF11YDR228C 1881 nt-0.21□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YDR426CYDR426C 378 nt-0.22□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YEL073CYEL073C 324 nt-0.22□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YFL012WYFL012W 447 nt-0.22□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YDR210WYDR210W 228 nt-0.24□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.24□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.24□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 YML007C-AYML007C-A 111 nt-0.24□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 ISF1YMR081C 1017 nt-0.24□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 snR128snR128 126 nt-0.24□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 BUL2YML111W 2763 nt-0.24□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 CBS1YDL069C 690 nt-0.25□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 YKL123WYKL123W 381 nt-0.25□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 YAR047CYAR047C 321 nt-0.25□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 YLR334CYLR334C 381 nt-0.25□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.25□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 snR8snR8 190 nt-0.26□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 YPL068CYPL068C 882 nt-0.26□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 DIE2YGR227W 1578 nt-0.27□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 HMRA2YCR096C 360 nt-0.27□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-0.27□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 QCR9YGR183C 201 nt-0.27□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 YHR125WYHR125W 306 nt-0.27□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 EAF6YJR082C 342 nt-0.28□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 YKL136WYKL136W 399 nt-0.28□□□□□ -2.45
YHR140WP38842 RPS25BYLR333C 327 nt-0.29□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-0.3□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 ECL1YGR146C 636 nt-0.3□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 YJL120WYJL120W 324 nt-0.3□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 FYV7YLR068W 456 nt-0.31□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 YLR282CYLR282C 342 nt-0.31□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt-0.31□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 YCR022CYCR022C 345 nt-0.32□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-0.32□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 YHR138CYHR138C 345 nt-0.32□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.32□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 SBH2YER019C-A 267 nt-0.33□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-0.33□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 PCC1YKR095W-A 267 nt-0.34□□□□□ -2.46
YHR140WP38842 BI2Q0110 1272 nt-0.35□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 YAR053WYAR053W 297 nt-0.35□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 YLR456WYLR456W 615 nt-0.35□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 YNL303WYNL303W 348 nt-0.35□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 YJL007CYJL007C 315 nt-0.36□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 STE18YJR086W 333 nt-0.36□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 YLR101CYLR101C 396 nt-0.37□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 TOM22YNL131W 459 nt-0.37□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 snR54snR54 86 nt-0.37□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 PRP39YML046W 1890 nt-0.37□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 YAR029WYAR029W 225 nt-0.38□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 HTB2YBL002W 396 nt-0.38□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 snR41snR41 95 nt-0.38□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 CSN9YDR179C 489 nt-0.39□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 SNU13YEL026W 381 nt-0.39□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 YHR130CYHR130C 336 nt-0.4□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.4□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.4□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 RAD61YDR014W 1944 nt-0.4□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 CSE1YGL238W 2883 nt-0.41□□□□□ -2.47
YHR140WP38842 PRM3YPL192C 402 nt-0.41□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 EST1YLR233C 2100 nt-0.42□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.42□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 YER006C-AYER006C-A 318 nt-0.43□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.43□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 YBR099CYBR099C 384 nt-0.43□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 YDR366CYDR366C 399 nt-0.44□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 BLI1YKL061W 342 nt-0.44□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 YNL122CYNL122C 348 nt-0.44□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 YPL205CYPL205C 345 nt-0.44□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.45□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 VPS20YMR077C 666 nt-0.46□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 YLR041WYLR041W 321 nt-0.47□□□□□ -2.48
YHR140WP38842 SEC10YLR166C 2616 nt-0.48□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 snR78snR78 87 nt-0.49□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 YNR025CYNR025C 360 nt-0.49□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.5□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.5□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 YLR434CYLR434C 384 nt-0.5□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.51□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.52□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.52□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.53□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 YFL063WYFL063W 456 nt-0.53□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 YGR164WYGR164W 336 nt-0.53□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 RPS27BYHR021C 249 nt-0.53□□□□□ -2.49
YHR140WP38842 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.54□□□□□ -2.5
YHR140WP38842 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.56□□□□□ -2.5
YHR140WP38842 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-0.56□□□□□ -2.5
YHR140WP38842 YDR048CYDR048C 315 nt-0.57□□□□□ -2.5
YHR140WP38842 YDR544CYDR544C 429 nt-0.57□□□□□ -2.5
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