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Protein–RNA interactions for Protein: P20485
CKI1, Choline kinase, yeast
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582 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
CKI1
P20485
YPR016W-A
YPR016W-A
261 nt
0.73
□□□□□ -2.29
CKI1
P20485
RKR1
YMR247C
4689 nt
0.71
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
YPL225W
YPL225W
441 nt
0.7
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
RPL26B
YGR034W
384 nt
0.69
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
YMR321C
YMR321C
318 nt
0.69
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
YNL211C
YNL211C
261 nt
0.68
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
LTE1
YAL024C
4308 nt
0.68
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
SSS1
YDR086C
243 nt
0.67
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
YHL046W-A
YHL046W-A
327 nt
0.67
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
YMR272W-A
YMR272W-A
114 nt
0.67
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
RPS30B
YOR182C
192 nt
0.67
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
YPL038W-A
YPL038W-A
192 nt
0.67
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
SGF11
YPL047W
300 nt
0.67
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
YPR197C
YPR197C
564 nt
0.67
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
NPR2
YEL062W
1848 nt
0.66
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
YPR159C-A
YPR159C-A
102 nt
0.66
□□□□□ -2.3
CKI1
P20485
INA22
YIR024C
651 nt
0.65
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
YMR031W-A
YMR031W-A
327 nt
0.65
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
YAF9
YNL107W
681 nt
0.65
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
CHS6
YJL099W
2241 nt
0.64
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
YIL115W-A
YIL115W-A
372 nt
0.64
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
YDR102C
YDR102C
333 nt
0.63
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
YOR218C
YOR218C
420 nt
0.63
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
ASE1
YOR058C
2658 nt
0.62
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
COG8
YML071C
1824 nt
0.62
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
YFR012W-A
YFR012W-A
87 nt
0.62
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
RPS27B
YHR021C
249 nt
0.62
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
SEC8
YPR055W
3198 nt
0.61
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
HTL1
YCR020W-B
237 nt
0.61
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
CSE2
YNR010W
450 nt
0.61
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
MYO1
YHR023W
5787 nt
0.61
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
YML002W
YML002W
2214 nt
0.59
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
tF(GAA)B
tF(GAA)B
73 nt
0.59
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
tF(GAA)F
tF(GAA)F
73 nt
0.59
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
tF(GAA)G
tF(GAA)G
73 nt
0.59
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
tF(GAA)H1
tF(GAA)H1
73 nt
0.59
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
tF(GAA)H2
tF(GAA)H2
73 nt
0.59
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
tF(GAA)M
tF(GAA)M
73 nt
0.59
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
tF(GAA)P1
tF(GAA)P1
73 nt
0.59
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
tF(GAA)P2
tF(GAA)P2
73 nt
0.59
□□□□□ -2.31
CKI1
P20485
YMR160W
YMR160W
2451 nt
0.59
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
UTP20
YBL004W
7482 nt
0.58
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YAL067W-A
YAL067W-A
228 nt
0.58
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YLR399W-A
YLR399W-A
105 nt
0.58
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YPR160W-A
YPR160W-A
81 nt
0.58
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
VIK1
YPL253C
1944 nt
0.58
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
snR60
snR60
104 nt
0.57
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YDL240C-A
YDL240C-A
138 nt
0.57
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YIL032C
YIL032C
357 nt
0.57
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
FYV10
YIL097W
1551 nt
0.57
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YCR018C-A
YCR018C-A
255 nt
0.56
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YDR183C-A
YDR183C-A
258 nt
0.56
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YMR307C-A
YMR307C-A
195 nt
0.55
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
snR36
snR36
182 nt
0.55
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YDL185C-A
YDL185C-A
228 nt
0.54
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
snR190
snR190
190 nt
0.54
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YDR354C-A
YDR354C-A
144 nt
0.53
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YGL149W
YGL149W
306 nt
0.53
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
COX5B
YIL111W
456 nt
0.53
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YIL134C-A
YIL134C-A
204 nt
0.53
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
YJL127W-A
YJL127W-A
117 nt
0.53
□□□□□ -2.32
CKI1
P20485
IQG1
YPL242C
4488 nt
0.53
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
HAL9
YOL089C
3093 nt
0.53
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
UTP10
YJL109C
5310 nt
0.52
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
YJL026C-A
YJL026C-A
222 nt
0.52
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
YMR193C-A
YMR193C-A
387 nt
0.52
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
PRP5
YBR237W
2550 nt
0.51
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
ATP6
Q0085
780 nt
0.51
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
GIM4
YEL003W
336 nt
0.51
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
BEM3
YPL115C
3387 nt
0.51
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
YFL063W
YFL063W
456 nt
0.5
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
PAU12
YGR294W
363 nt
0.5
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
YKL145W-A
YKL145W-A
93 nt
0.5
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
OST4
YDL232W
111 nt
0.49
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
QCR9
YGR183C
201 nt
0.49
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
YHR175W-A
YHR175W-A
150 nt
0.49
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
YKL136W
YKL136W
399 nt
0.49
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
PRP42
YDR235W
1635 nt
0.49
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
YSP1
YHR155W
3687 nt
0.48
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
HMRA1
YCR097W
381 nt
0.48
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
YEL020C-B
YEL020C-B
198 nt
0.48
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
PET111
YMR257C
2403 nt
0.48
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
snR56
snR56
88 nt
0.47
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
YFL032W
YFL032W
321 nt
0.47
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
YJL197C-A
YJL197C-A
282 nt
0.47
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
YNL028W
YNL028W
318 nt
0.47
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
YOL014W
YOL014W
375 nt
0.47
□□□□□ -2.33
CKI1
P20485
MLP2
YIL149C
5040 nt
0.46
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
RPL39
YJL189W
156 nt
0.46
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
YLR282C
YLR282C
342 nt
0.46
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
MLP1
YKR095W
5628 nt
0.46
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
YKL118W
YKL118W
312 nt
0.45
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
YDR413C
YDR413C
576 nt
0.43
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
FMP27
YLR454W
7887 nt
0.43
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
COY1
YKL179C
2040 nt
0.43
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
SBH1
YER087C-B
249 nt
0.42
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
YER097W
YER097W
330 nt
0.41
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
tN(GUU)Q
tN(GUU)Q
71 nt
0.41
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
BLI1
YKL061W
342 nt
0.41
□□□□□ -2.34
CKI1
P20485
YKL100W-A
YKL100W-A
90 nt
0.41
□□□□□ -2.34
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