Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc8E9PWG2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc8E9PWG2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc8E9PWG2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms