Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd4A2AKM2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd4A2AKM2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms