Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Col9a3A2ACT7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col9a3A2ACT7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms